在中世纪的医学院有显著杰佛逊校友强的大学教师。的1841个“著名教师”包括Robley Dunglison教授（医学院）、John K. Mitchell（行医）、Joseph Pancoast（解剖学）、Thomas D. Mütter（外科实践）、Charles D. Meigs（妇产科）、Franklin Bache（化学）、Robert Huston（本草纲目）。1856，一个著名的研究生，Samuel D. Gross，MD（1828级），返回给母校的声誉，一直持续到今天。Gross博士是杰出的医学专业。在他那个时代最好的外科医生的最高荣誉，一个教育家，著有14本书，Gross博士（画家Thomas Eakins不朽的“总医院”）认为自己首先是一个医生，谁花了很多时间家庭实践。

19世纪早期，宾夕法尼亚州的一些医生试图建立该州的第二所医学院，但遭到宾夕法尼亚大学医学院校友的阻挠。最终在George McClellan等医生的努力下，在1825年于杰斐逊大学（现华盛顿与杰弗逊学院）成立了单独的医学院。1844年，杰斐逊在第十大道和桑瑟姆街开设了提供床铺的医院。1877年成为全美最早的医学院附属医院之一。1891年成立了护理学院。1969年7月1日，医学院独立称校，校名“托马斯杰斐逊大学”。托马斯杰斐逊大学也是杰弗逊的卫生系统中较早成立的机构。托马斯杰斐逊大学是全美现存最早的第九所医学院。